4 мая 2006 года жертва была доставлена в ГРОВД г. Бирск Республики Башкортостан, где была подвергнута пыткам со стороны членов следственной оперативной группы с целью получения самооговора в совершении преступления. Жертву с помощью наручников и веревки связывали в неудобном положении, на голову надевали пакет. Не добившись желаемых показаний, правоохранители доставили Минибаева в следственный отдел прокуратуры Республики Башкортостан г. Уфы, где ранним утром 5 мая жестоко избили. Избиение сопровождалось угрозами причинения увечий – следователь республиканской прокуратуры грозился выколоть Минибаеву глаз и отрезать ухо хирургическим скальпелем. Не выдержав пыток, измученная и напуганная жертва была вынуждена себя оговорить. 6 мая 2006 года, при водворении в следственный изолятор во время медицинского осмотра дежурным фельдшером ФГУ ИЗ 3/1 ГУФСИН России по РБ у Рудика Минибаева были обнаружены телесные повреждения. Проверка по данному факту прокуратурой республики была начата лишь 16 июня 2006 года и велась крайне неэффективно. 20 июля 2006 года мать жертвы обратилась к правозащитникам за помощью. Всего за период с 2006 по 2014 годы в ходе доследственной проверки, проводимой органами следствия по факту получения Минибаевым телесных повреждений, было вынесено 6 постановлений об отказе в возбуждении уголовного дела, 5 из которых были отменены как незаконные. Действием, призванным стимулировать расследование на национальном уровне, стала жалоба, поданная правозащитниками 20 ноября 2009 года в Европейский суд по правам человека. После этого доследственная проверка неоднократно возобновлялась, пока 22 февраля 2014 года по материалу не было вынесено постановление об отказе в возбуждении уголовного дела, ставшее окончательным. Жалоба в интересах Рудика Минибаева была коммуницирована властям РФ 6 марта 2014 года, однако предварительная проверка по факту получения им телесных повреждений так и не была возобновлена. 3 декабря 2019 года, спустя 13 лет после события преступления, Европейский суд по правам человека в своём постановлении признал нарушение ст. 3 и ст. 5 Конвенции и присудил жертве компенсацию морального вреда в размере 25 350 евро.