Дело братьев Подсвировых является знаковым для организации; в рамках работы по этому материалу нижегородским правозащитникам впервые удалось привлечь сотрудника милиции к уголовной ответственности за применение пыток. 14 января 1999 г. братья Максим и Алексей Подсвировы были последовательно задержаны и доставлены в Нижегородское РУВД, где подверглись избиению сотрудником милиции с целью получения признательных показаний в совершении преступления, которое они не совершали. Под пыткой младший брат оговорил старшего. 20 января оба брата обратились в Нижегородское общество прав человека (НОПЧ) с просьбой о помощи в восстановлении справедливости и наказании виновных. На следующий день на имя сотрудников НОПЧ были оформлены доверенности на представление интересов Подсвировых по делу о применении к ним незаконного насилия со стороны сотрудников милиции. В дальнейшем информационно-аналитический центр НОПЧ и созданный на его основе в августе 2000 г. Комитет против пыток провели по данному делу серию мероприятий, получившую впоследствии название общественного расследования. По направлению старшего помощника прокурора Нижегородского района Волкова И.А. оба брата прошли судебно-медицинское освидетельствование, которое зафиксировало у них аналогичные телесные повреждения. 17 февраля Наталья Подсвирова, мать братьев, получила ответ из прокуратуры Нижегородского района, в котором прокурор Моисеев А. В. уведомил её, что по её заявлениям возбуждено уголовное дело № 68322 по ч. 3 ст. 286 УК РФ. Расследование было поручено следователю прокуратуры Милькову Андрею Петровичу Впоследствии правозащитникам пришлось столкнуться с целой серий незаконных прекращений уголовного дела, а также с регулярным неуведомлением заявителей и их представителей о ходе следствия. Все незаконные решения и действия должностных лиц последовательно обжаловались в прокуратуре и суде. Следует отметить, что следователь Мильков, последовательно саботировавший расследование данного дела, вскоре сам стал фигурантом громкого уголовного дела о пытках и изнасиловании вызванной на допрос 19-летней свидетельницы (см. дело общественного расследования "Комитет против пыток в защиту прав Ольги Масловой и Федора Налбандова") Уголовное дело о пытках братьев Подсвировых дошло до суда в достаточно усечённом виде. Из него выпал эпизод с истязанием старшего брата и остался только один обвиняемый; остальные сотрудники милиции, участвовавшие в фабрикации доказательств, к ответственности привлечены не были. По итогам серии судебных решений разных инстанций применивший пытки оперуполномоченный Иванов А. Г. был приговорен к шести годам лишения свободы условно.